Publications

Thesis

  1. “A Fiber-Optic Loop Memory Structure Based on Coherent Optical Code Division Multiple Access” Bülent Yılmaz, Yüksek Lisans Tezi, Orta Doğu Teknik Üniversitesi, 1999.
  2. “Venous Catheter Based Mapping of Epicardial Ectopic Activation using Statistical Estimation” Bülent Yılmaz, Doktora Tezi, Utah Üniversitesi, 2004.

Journal Papers

  1. Karacavus, S., B. Yılmaz, A. Tasdemir, Ö. Kayaaltı, E. Kaya, S. İçer, O. Ayyıldız, E. Vardareli, M.H. Asyalı, “Can Laws’ be a potential PET image texture analysis approach for evaluation of tumor heterogeneity and histopathological characteristics in NSCLC?” Computer Methods and Programs in Biomedicine, Accepted, (2016)
  2. Yılmaz, B., S. Korkmaz, D.B. Arslan, E. Güngör, M.H. Asyalı, “Like/Dislike Analysis Using EEG: Determination of Most Discriminative Channels and Frequencies”, Computer Methods and Programs in Biomedicine, 113(2), 705-713 (2014)
  3. Kayaaltı, Ö., B. H. Aksebzeci, İ. Ö. Karahan, K. Deniz, M. Öztürk, B. Yılmaz, S. Kara, M. H. Asyalı, “On The Staging of the Liver Fibrosis Using Image Processing”, under review (2013)
  4. Yılmaz, B., E. Çiftçi “An FDTD-Based Computer Simulation Platform for Shock Wave Propagation in Electrohydraulic Lithotripsy”, Computer Methods and Programs in Biomedicine, 110, 389-398 (2013)
  5. Kaya, K.A., B. Yılmaz, “A new tool for QT interval analysis during sleep in healthy and obstructive sleep apnea subjects: A study on women”, Turkish Journal of Electrical Engineering and Computer Sciences, 21, 1504-1513 (2013)
  6. Şener, E., N. Yüksel, D. K. Yıldız, B. Yılmaz, Ö. Özdemir, Y. Çağlar, E. Değirmenci, “The Impact of Subconjuctivally Injected EGF and VEGF Inhibitor on Experimental Corneal Neovascularization in Rat Model”, Current Eye Research, 36(11), 1005–1013 (2011)
  7. Yılmaz, B., U. Cunedioğlu, E. Baysoy, Usage of Spline Interpolation in Catheter-based Cardiac Mapping”, Turkish Journal of Electrical Engineering and Computer Sciences, 18(6), 989-1002 (2010)
  8. Yılmaz, B., M. H. Asyalı, E. Arıkan, S. Yetkin, F. Özgen, “Sleep stage and obstructive apneaic epoch classification using single-lead ECG”, BioMedical Engineering Online, 9:39 (2010)
  9. Baysoy, E., U. Cunedioğlu, B. Yılmaz, “Simultaneous Mapping of Endocardium and Epicardium from Multielectrode Intrachamber and Intravenous Catheters: A Computer Simulation-based Validation”,Journal of Electrocardiology, 43(1), 56-62 (2010)
  10. Cunedioğlu, U. ve B. Yılmaz “Combination of Computer Simulations and Experimental Measurements as the Training Dataset for Statistical Estimation of Epicardial Activation Maps from Venous Catheter Recordings” IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 56(3), 837–845 (2009)
  11. Sunay, A. S., U. Cunedioğlu ve B. Yılmaz“Feasibility of Probabilistic Neural Networks, Kohonen SOM and Fuzzy Clustering for Source Localization of Ventricular Focal Arrhythmias from Intravenous Catheter Measurements” Expert Systems, 26(1), 70–81 (2009)
  12. Yılmaz, B. ve U. Cunedioğlu “Source Localization of Focal Ventricular Arrhythmias using Linear Estimation, Correlation, and Back Propagation Networks,” Computers in Biology and Medicine, 37, 1437–1445 (2007)
  13. Yılmaz, B. “Epicardial Potential Distribution Reconstruction from Recordings of Intravenous and Transthoracic Mapping Catheters: A Feasibility Study”, Medical Engineering & Physics, 29, 937–945 (2007)
  14. Erdurmuş, M., R. Yağcı, B. Yılmaz, I. F. Hepşen, C. Türkmen, B. Aydın ve R. Karadağ “Inhibitory Effects of Topical Thymoquinone on Corneal Neovascularization”, Cornea, 26, 715–719 (2007)
  15. Yılmaz, B. ve R. S. MacLeod “Generalized Training Subset Selection for Statistical Estimation of Epicardial Activation Maps From Intravenous Catheter Measurements”, Computers in Biology and Medicine, 37, 328–336 (2007)
  16. Yılmaz, B. “Epicardial Activation Mapping from Transcoronary and Transpericardial Catheter Measurements: A Canine Heart Model”, Türk Aritmi, Pacemaker ve Elektrofizyoloji Dergisi, 5, 23-2, (2006).
  17. Yılmaz, B., R. S. MacLeod, B.B. Punske, B. Taccardi ve D. H. Brooks. “Venous Catheter Mapping of Epicardial Ectopic Activation: Training Set Selection for Statistical Estimation” IEEE Transactions on Biomedical Engineering, vol. 52, No. 11,1823-1831 (2005).
  18. Serinagaoglu, Y., R..S. MacLeod, B. Yılmaz ve D. H. Brooks. “Multielectrode Venous Catheter Mapping as a High Quality Constraint for Electrocardiographic Inverse Solution” Journal of Electrocardiology; vol. 35, no. 4, 65-74 (2002)
  19. MacLeod, R. S., B. Yılmaz, B. Taccardi, B. B. Punske, Y. Serinagaoglu ve D. H. Brooks “Direct and Inverse Methods for Cardiac Mapping Using Multielectrode Catheter Measurements”J. Biomedizinische Technik; vol. 46, 207-208 (2001)
  20. MacLeod, R.S., B. B. Punske, B. Yilmaz, S. Shome ve B. Taccardi “The Role of Heart Rate in Myocardial Ischemia from Restricted Coronary Perfusion”. Journal of Electrocardiology; vol. 34, 43-51 (2001)
  21. MacLeod, R.S., Q. Ni, B. B. Punske, P. R. Ershler, B. Yılmaz ve B. Taccardi “Effects of Heart Position on the Body-Surface ECG”. Journal of Electrocardiology; vol. 33, 229-37 (2000)

International Conference Papers

  1. Karaçavuş, S. B. Yılmaz, Ö. Kayaaltı, A. Taşdemir, E. Kaya, S. İçer, O. Ayyıldız, K. Eset, E. Vardareli, M.H. Asyalı, “Comparison of 3D texture features and metabolic parameters obtained from 18-F FDG-PET/CT images for evaluating tumor stage and subtype in non-small cell lung cancer”, Annual Congress of the European Association of Nuclear Medicine, Hamburg, Germany, 10-14 October 2015.
  2. Kayaaltı, Ö., S. Karaçavuş, B. Yılmaz, T. Şengezer, S. Ilgan, M.H. Asyalı, “Usefulness of ultrasonographic texture features in discriminating metastasic from benign lymph nodes”, International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (ICBBE), Suzhou, China, 20-22 September 2014.
  3. Karaçavuş, S., B. Yılmaz, A. Taşdemir, O. Kayaaltı, E. Kaya, S. İçer, O. Ayyıldız, E. Vardareli, M. H. Asyalı, “Assessment of relationship between texture analysis parameters obtained from 18-F FDG-PET/CT images and tumor metabolism and histopathological findings in non-small cell lung cancer”, Annual Congress of the European Association of Nuclear Medicine (EANM), Gothenburg, Sweden, 18-22 October 2014.

  4. Yılmaz, B., S. Korkmaz, D.B. Arslan, E. Güngör, M.H. Asyalı “Determination of Most Discriminative Channels and Frequencies in Neuromarketing using Logistic Regression” Second DEMOVE Symposium 2013, Göttingen, Germany, 22-23 October 2013.
  5. Kayaaltı, O., B.H. Aksebzeci, I.O. Karahan, K. Deniz, M. Ozturk, B. Yilmaz, S. Kara, M.H. Asyali “Staging of the liver fibrosis from CT images using texture features” Proceedings of 7th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT), Nevşehir, Turkey, 19-22 April 2012.
  6. Cunedioğlu, U., E. Baysoy ve B. Yılmaz “Usage of Cardiac Simulation Results in Source Localization of Focal Epicardial Arrhythmias using Statistical Estimation”. Proceedings of the 30th Annual International Conference of the IEEE EMBS, Vancouver, British Columbia, Canada. 20-24 August 2008.
  7. Sunay, A. S., U. Cunedioğlu ve B. Yılmaz, “Estimation of Source of Venticular Focal Arrhythmias using Kohonen Self-Organizing Maps and Probabilistic Neural Networks” Proc. INISTA, İstanbul, Türkiye, 2007.
  8. Yılmaz, B., U. Cunedioğlu ve O. Çakır "Arrhythmia Source Localization from Intravenous and Transthoracic Catheter Measurements” Proc. 28th IEEE EMBS, New York, ABD, 1568 – 1571, IEEE, Aug., 2006.
  9. Yılmaz, B. ve R. S. MacLeod " Instance Selection for Estimation of Epicardial Activation Sequence from Venous Catheter Measurements” Proc. 28th IEEE EMBS, New York, ABD, 3982 – 3985, IEEE, Aug., 2006.
  10. Yılmaz, B., R. S. MacLeod “Selection of the Number and Location of Leads Catheter Based Epicardial Mapping”, BEM/NFSI Conference, 12-15 May 2005, Minneapolis, Minnesota, USA.
  11. Yılmaz, B., R. S. MacLeod “Venous Catheter Based Mapping of Epicardial Ectopic Activation”, Proceedings of the 26th Annual International Conference of the IEEE EMBS, San Francisco, California, USA. 1-5 September, 2004.
  12. Yılmaz, B., R. S. MacLeod, S. Shome, B. B. Punske ve B. Taccardi “Minimally Invasive Epicardial Activation Mapping from Multielectrode Catheters”, IEEE BMES 23. International Conference; vol: 1, page 290 -293, İstanbul, Türkiye, 2001.

National Conference Papers

  1. Eset, K., S. İçer, S. Karaçavuş, B. Yılmaz, Ö. Kayaaltı, O. Ayyıldız, E. Kaya “PET Görüntülerinde Akciğer Tümörü Segmentasyonu Yöntemlerinin Karşılaştırılması” Tıp Teknolojileri 2015, Bodrum, 15-18 Ekim, 2015.
  2. Ayyıldız, O., B. Yılmaz, S. Karaçavuş, Ö. Kayaaltı, S. İçer, K. Eset, E. Kaya “Akciğer Tümörlü Hastaların PET ve BT Görüntülerinin Çakıştırılıp Birleştirilmesi” Tıp Teknolojileri 2015, Bodrum, 15-18 Ekim, 2015.
  3. Oralhan, Z., R. Aldemir, M. Tokmakçı, B. Yılmaz “Görsel uyaranların EEG sinyalleri üzerindeki etkilerinin incelenmesi” 12. Ulusal Sinirbilim Kongresi, İstanbul, 28-31 Mayıs 2014.
  4. Oralhan, Z., M. Tokmakçı, B. Yılmaz “Beyin Bilgisayar Arayüzü Sistemlerinde Görsel Uyaranların Alfa Dalgaları Üzerindeki Etkileri” Tıp Teknolojileri 2014, Ürgüp, 25-27 Eylül, 2014.
  5. Kayaaltı, Ö., S. Karaçavuş, B. Yılmaz, T. Şengezer, S. Ilgan, M.H. Asyalı “Ultrasonografide iyi huylu lenf düğümlerini metastazik lenf düğümlerinden doku özellikleriyle ayırt etme” Tıp Teknolojileri 2014, Ürgüp, 25-27 Eylül, 2014.
  6. Karaçavuş, S., Ö. Kayaaltı, B. Yılmaz, S. İçer, E. Kaya, O. Ayyıldız “PET/BT Görüntülerinden Doku Analizi Yöntemiyle Elde Edilen Parametrelerin Küçük Hücreli Dışı Akciğer Kanseri Evrelemesinde Kullanılması” Tıp Teknolojileri 2014, Ürgüp, 25-27 Eylül, 2014.
  7. Karaçavuş, S., B. Yılmaz, A. Taşdemir, Ö. Kayaaltı, M. Altınkaynak, E. Kaya, S. İçer, Ç. Acer, O. Ayyıldız, E. Vardareli “Pozitron Emisyon Tomografisi Görüntülerinden Doku Analizi Yöntemiyle Elde Edilen Parametrelerin Tümör Metabolizması ve Evresiyle İlişkisi” 26. Ulusal Nükleer Tıp Kongresi, 16-20 Nisan 2014, Antalya, 2014.
  8. Yılmaz, B., S. Korkmaz, etc. “Genç bayanlarda EEG tabanlı beğeni durumunun belirlenmesi için lojistik regresyon yönteminin kullanılması” Tıp Teknolojileri 2013, Antalya, 31 Ekim-2 Kasım, 2013.
  9. Yılmaz, B., D. B. Arslan, etc. “Göz Hareketine Dayalı Hasta Yatağı Pozisyon Kontrolü İçin Arayüz Geliştirilmesi”, in the Proceedings of the Tıp Teknolojileri 2013 Conference, Antalya, Turkey, October 31-November 2, 2013.
  10. Yazgı, S., B. Yılmaz, E. Şener, “Korneada Yeni Damar Oluşumu Seviyesinin Nicellenmesi için Yeni Bir Görüntü İşleme Yaklaşımı” 16. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı, Antalya, 2011.
  11. Kaya, K. A., B. Yılmaz, “Uzun Uyku Elektrokardiyografisi Kayıtları Üzerinde QT Aralığı Analizi için Yeni Bir Yöntem” 16. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı, Antalya, 2011.
  12. Yarıkkaş, B., İ. C. Koçum, B. Yılmaz, “Cerrahi Operasyonlarda Hasta Vücudunda Unutulan Ameliyat Malzemelerinin Tespitine Yönelik Cihaz Tasarımı ve İmalatı” 15. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı, Antalya, 2010.
  13. Yılmaz, B., E. Arıkan, M. H. Asyalı “Tek Kanallı EKG Kayıtlarından Uyku Evrelemesi Yapılmasında kNN ve Kuadratik Diskriminant Analizi Yöntemlerinin Kullanılması” 15. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı, Antalya, 2010.
  14. Erdem, R., E. K. Şimşek, D. Türkbey, B. C. Çelik, E. Kocaman, F. Keskin, Ş. Kosdak ve B. Yılmaz “Siklooksijenaz-2 İnhibisyonu Farelerde Strese Bağlı Öğrenme-Bellek Bozulmasını Potansiyalize Eder” 20. Ulusal Farmakoloji Kongresi, Antalya, 2009.
  15. Çiftçi, E. ve B. Yılmaz “Elektrohidrolik Litotripside Kullanılan Şok Dalgasının Benzetimi ve Dalga Performansının Eniyilenmesi” 14. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı, İzmir, 2009.
  16. Cunedioğlu, U., E. Baysoy ve B. Yılmaz “Kalbin İç ve Dış Yüzeylerinin Aynı Anda Haritalanması İçin İstatistiksel Kestirim Yönteminin Kullanılması” 14. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı, İzmir, 2009.
  17. Eken, A., K. Şerbetçi, O. Tüfekçioğlu ve B. Yılmaz “Ekokardiyografi Görüntülerindeki Gerginlik Oranının MATLAB kullanılarak İncelenmesi”, 14. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı, İzmir, 2009.
  18. Baysoy, E., U. Cunedioğlu ve B. Yılmaz “Endokardiyal Aritmilerin Katetere Dayalı Haritalanması için Yeni Konumsal Aradeğerleme Yöntemleri” 17. Sinyal İşleme ve İletişim Uygulamaları Konferansı, Antalya, 2009.
  19. Baysoy E., U. Cunedioğlu, B. Yılmaz, “Kalbin İç Yüzeyinin Elektriksel Haritalanmasındaki Seyrek Ölçüm Problemi için Konumsal Aradeğerleme Tekniklerinin Kullanılması”. BİYOMUT 2008, 29-31 Mayıs 2008, Ankara, Türkiye.
  20. Cunedioğlu U., O. Çakır, E. Baysoy, B. Yılmaz, Deneysel Ektopik Aktivasyon Zamanı Haritaları ile Hücresel Otomata ve Aliev-Panfilov Modeline Dayalı Bilgisayar Benzetim Sonuçlarının Karşılaştırılması”, BİYOMUT 2008, 29-31 Mayıs 2008, Ankara, Türkiye.
  21. Yılmaz B., U. Cunedioğlu, E. Baysoy, İstatistiksel Kestirim Yöntemiyle Aritmi Kaynağı Tesbitinde Bilgisayarlı Benzetim Sonuçlarının Kullanılması”. BİYOMUT 2008, 29-31 Mayıs 2008, Ankara, Türkiye.
  22. Yorulmaz M., U. Cunedioğlu, B. Yılmaz, “Hayvanların Konumsal Davranışlarının İncelenmesi için Matlab Tabanlı bir Görüntü İşleme Yazılımı Geliştirilmesi”. BİYOMUT 2008, 29-31 Mayıs 2008, Ankara, Türkiye.
  23. Yılmaz B., H. Akçay, “Türkiye’de Türünün İlk Örneği: Başkent Üniversitesi Biyomedikal Mühendisliği Lisans Programı”. BİYOMUT 2008, 29-31 Mayıs 2008, Ankara, Türkiye.
  24. Cunedioğlu U., O. Çakır ve B. Yılmaz. “Aliev-Panfilov Modeli Kullanarak Kalbin Elektriksel Aktivitesinin Üç Boyutlu Simülasyonu ve Deneysel Verilerle Karşılaştırılması”, BİYOMUT 2007,22-23 Mayıs 2007, İstanbul, Türkiye.
  25. Türegün D., U. Cunedioğlu, B. Yılmaz, Y. S. Doğrusöz “Elektrokardiyografik Geri Problem Çözümü için Regülarizasyon Araç Kutusu ve Kullanıcı Arayüzü Geliştirilmesi”,. BİYOMUT 2007, 22-23 Mayıs 2007, İstanbul, Türkiye.
  26. Yılmaz B., U. Cunedioğlu, O. Çakır “Toplardamar İçindeki ve Göğüs Kafesinden İçeriye Sokulan Kateterlerin Kalp Haritalaması için Eşzamanlı Kullanımı”, BİYOMUT 2006, 25-28 Mayıs 2006, İstanbul, Türkiye.
  27. Yılmaz B., O. Çakır, U. Cunedioğlu, V. Tuncay “Kalbin Dış Yüzeyinin Elektriksel Haritalamasında Aradeğerleme Tekniklerinin Kullanılması”, BİYOMUT 2006, 25-28 Mayıs 2006, İstanbul, Türkiye.
  28. Türkmen C., U. Cunedioğlu, F. Kural, B. Yılmaz “Manyetik Rezonans Görüntüleri Kullanarak Beyin Tümörünün Görüntüden Ayrıştırılması ve Hacminin Belirlenmesinde Yarı-Otomatik Bir Yöntem”, BİYOMUT 2006, 25-28 Mayıs 2006, İstanbul, Türkiye.
  29. Yılmaz, B., U. Cünedioğlu “Yapay Sinir Ağları kullanarak Ektopik Epikardiyal Aktivasyonun Venöz-katetere dayalı haritalanması”, BİYOMUT 2005. 25-27 Mayıs 2005, İstanbul, Türkiye.